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質粒構建的過程有哪些?

更新時間:2024-01-04點擊次數(shù):3242

    質粒構建是分子生物學研究中zui常用的實驗技術,原理依賴于限制性核酸內切酶,DNA連接酶和其他修飾酶的作用,分別對目的基因和載體DNA進行適當切割和修飾后,將二者連接在一起,再導入宿主細胞,實現(xiàn)目的基因在宿主細胞內的正確表達。那么你知道質粒構建的過程有哪些嗎?讓我們一起來看看吧!

一、質粒載體制備

    質粒載體的制備既可以選擇單酶切也可以選擇雙酶切,一般推薦使用雙酶切。其實目的就只有一個,盡量使載體的末端具有特異性,防止自連。

1)選擇質粒上兩個酶切位點的距離不應小于太?。?gt;10bp),否則影響限制性內切酶對切點的識別,不利于空載體的雙酶切。

2)一般目的基因用于克隆表達的情況下,酶切位點的選擇要考慮到:目的基因片段內部不含有所選的酶切位點(不然鑒定陽性重組子雙酶切時會將目的基因切斷)。

3)實驗后繼應用的所有載體(真核、原核、酵母、昆蟲)都盡可能含有所選的酶切位點。并且要保證在載體上的插入方向正確(定向克隆)。(不然換載體表達時,還要重新設計引物,以引進新的酶切位點)。

4)盡可能選比較常用的酶切位點(常用切點酶的價格比較便宜)。

5)兩個酶切點至少隔上3個堿基。

6)兩個酶切點最好不要是同尾酶(切下來的殘基不要互補),否則效果相當于單酶切。

7)最好使用酶切效率高的酶。

8)最好使用雙酶切有共同buffer的酶。

二、目的片段制備

    主要使用PCR擴增的手段,首先要對目標片段進行擴增富集。PCR 即聚合酶鏈式反應,它是一種用于擴增復制特定 DNA 片段的常用分子生物學技術。PCR 的最大特點是能將微量的 DNA 大幅擴增,在克隆前獲得大量的目標基因片段。

    利用引物設計軟件如 Primer 5 或 NCBI Primer-BLAST 在線設計引物并合成后,配制 PCR 反應體系:將模板、引物、dNTP、酶、反應緩沖液和 ddH?O 按比例加入,加好后輕微點離,放入 PCR 儀中擴增目的片段,擴增后通過瓊脂糖凝膠檢測目的片段大小是否正確。

三、酶切連接

    獲得目標片段后,要與我們的質粒載體進行連接,必須借助兩個工具來實現(xiàn)——酶切工具(限制性內切酶)和連接工具(DNA 連接酶),這里使用的內切酶在我們的片段和載體上產生的接口一定要相同,不然DNA連接酶是無法將它們連接上的。

四、轉化鑒定

    將連接產物加入感受態(tài)細胞(常見的感受態(tài)細胞:DH5α、BL21,他們可是轉運過程的小能手,負責質粒的克隆和表達,這里下期科普百科會詳細介紹),冰上放置30min、42°C 熱激轉化或電轉化,加入無抗性 LB 培養(yǎng)基,200rpm -37°C 搖床搖 45-60min 后,涂至抗性或者其他篩選平板上,37°C 培養(yǎng)過夜、挑取 3-5 單個克隆搖菌、菌落 PCR 或提取質粒后酶切鑒定、鑒定完畢后送質?;蚓簻y序驗證。

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